Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3cO35066 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kif3cO35066 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif3cO35066 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms