Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap23O09044 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap23O09044 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap23O09044 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snap23O09044 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms