Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps1O08983 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hps1O08983 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps1O08983 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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