Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra2O08842 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms