Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckarO08786 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckarO08786 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CckarO08786 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms