Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltaO08585 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltaO08585 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CltaO08585 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CltaO08585 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CltaO08585 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CltaO08585 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CltaO08585 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltaO08585 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltaO08585 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltaO08585 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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