Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf6O08584 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf6O08584 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf6O08584 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms