Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efna5O08543 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efna5O08543 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna5O08543 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms