Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MsmbO08540 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms