Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6871L7N248 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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