Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20878L7N244 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20878L7N244 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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