Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20939L7N243 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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