Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms