Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm379J3QQ19 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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