Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5225J3QPL3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms