Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8356J3QPD3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms