Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim18J3QNP2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Smim18J3QNP2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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