Protein–RNA interactions for Protein: J3QN10

Gm16434, Predicted gene 16434, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16434J3QN10 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm16434J3QN10 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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