Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a18J3QN01 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms