Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms