Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm21818J3KMS6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm21818J3KMS6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21818J3KMS6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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