Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp17ldG5E8G2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp17ldG5E8G2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms