Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r67G5E8C1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r67G5E8C1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms