Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pcf11G3X9Z4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcf11G3X9Z4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pcf11G3X9Z4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcf11G3X9Z4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcf11G3X9Z4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcf11G3X9Z4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcf11G3X9Z4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcf11G3X9Z4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcf11G3X9Z4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms