Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms