Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef1G3X9K3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms