Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc9a3G3X939 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc9a3G3X939 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms