Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScaperF8VQ70 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScaperF8VQ70 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms