Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LctF8VPT3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LctF8VPT3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms