Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms