Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3371F7CQW8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3371F7CQW8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms