Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm20538F6Z9R1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms