Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms