Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crocc2F6XLV1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crocc2F6XLV1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms