Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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