Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28305F6U473 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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