Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm340F6RGI3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms