Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29094F6Q785 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29094F6Q785 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms