Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms