Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd35E9Q9D8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms