Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BC005561E9Q5E2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms