Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms