Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ApobE9Q414 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms