Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg1E9Q355 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Catsperg1E9Q355 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms