Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep350E9Q309 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep350E9Q309 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301.8 ms