Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms