Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0R1

Gm8159, Predicted gene 8159, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8159E9Q0R1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8159E9Q0R1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8159E9Q0R1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms