Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms