Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20425E9Q035 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms