Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx60E9PZQ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx60E9PZQ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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